科搭 Codar 文档中心

科搭 Codar 是 SpeedAI 出品的桌面端科研 Agent：管理文献、按任务调用专业科研插件，并提供生信模式完成单细胞与转录组分析。了解产品信息、支持平台、计费方式和常见问题。

科搭 Codar 是面向研究者的桌面 AI Agent 工作台，把大模型对话、项目文件、浏览器会话、Skills 插件、MCP 连接器和长任务执行放在同一个桌面里。本文介绍它的核心能力、适用场景和产品架构，对比它与传统 AI 对话工具的区别，并给出推荐的阅读顺序。

第一次使用科搭 Codar 先看这篇：了解 Codar 是什么、有哪些核心能力和适用场景，做好开始前的准备，然后登录、配置 AI 模型、创建第一个项目，并发起你的第一个科研任务。适合刚下载 Codar 的新用户按步骤上手。

科搭 Codar 支持 Windows 和 macOS。本页帮你选择对应系统的安装教程，完成客户端下载、安装和首次启动，并说明如何卸载 Codar。Windows 10 及以上可通过官网安装包或 Microsoft Store 安装，Mac 提供 Apple Silicon 与 Intel 通用版。

在 Windows 上安装科搭 Codar 有两种方式：下载官网安装包，按步骤选择安装范围和安装位置完成安装；或者通过 Microsoft Store 安装并自动获取更新。安装完成后首次启动并登录 Codar 即可开始使用，适用于 Windows 10 及以上版本。

在 Mac 上安装科搭 Codar 的完整步骤：下载 Apple Silicon / Intel 通用安装包，打开安装包并复制到“应用程序”，启动并登录，然后开始第一个任务。本文还介绍首次使用需要的系统权限、如何更新到新版本，以及如何卸载 Codar。

科搭 Codar 默认开启自动更新检查，启动时会在后台检测新版本，也可以在“设置 → 关于”中手动重启更新；手动更新时下载最新安装包覆盖安装即可，用户数据和配置不会丢失。本文还说明如何查看当前版本号。

介绍科搭 Codar 如何组织和管理对话：对话的基本概念、新建对话、按项目归类，以及置顶、重命名、归档和搜索等常用操作。同时开展多个研究任务时，用这些方法保持每个对话上下文清晰、历史记录随时可查。

介绍在科搭 Codar 任务对话中如何工作：认识对话界面，查看任务的执行步骤，随时补充要求或继续追问，添加文件，以及暂停和继续任务。文末给出使用建议，帮助你在长任务执行过程中掌握进度和结果。

了解科搭 Codar 任务产出的类型和管理方式：产出文件会自动保存，可以在文件列表中查看任务结果，并支持单文件导出、批量导出和复制到剪贴板。报告、图表、表格和脚本等交付物都可以从这里取用和分享。

跟着本教程从零完成一段完整的 Codar 研究任务：用一句话描述任务，选择工作目录，通过“+”菜单添加文件和上下文，任务开始后查看执行过程与任务产出，再继续追问、深入分析。文末整理了新手最常遇到的问题和解决办法。

Codar 提供通用模式和生信模式，模式决定处理任务时关注的方向和默认能力。本文说明两种模式分别适合什么任务、如何切换，以及选择时的注意事项。做单细胞、转录组等生物信息学分析时，建议切换到生信模式。

说明如何在科搭 Codar 中新建对话：基础创建步骤，为任务选择合适的模型和执行权限，设置研究领域，以及使用内置对话模板快速开始。创建后可以在对话中查看任务进度，并随时补充要求。

科搭 Codar 文献库是本地优先的文献管理工具：用文件夹整理文献，支持 PDF、DOI / arXiv、BibTeX / RIS、手动添加和 Zotero 导入，可以按关键词搜索、高级筛选，还能围绕单篇文献和 Codar 对话，把文献直接带进研究任务。

Codar 插件系统把可复用的研究流程、工具调用方式和领域知识封装成 Skills 插件和 MCP 连接器。本文介绍插件类型，如何安装插件包、浏览和安装组件，以及启用、停用和管理已安装的插件，让常见研究任务不必每次从零开始。

用科搭 Codar 定时任务让周期性的研究工作自动运行，比如每周追踪新文献、整理组会周报和数据质量巡检。本文介绍三种创建方式：使用推荐模板、手动创建和通过聊天创建，以及执行频率选项、任务配置和定时任务的执行流程。

Codar 可以接入常用的消息平台，让你在手机上发起任务、接收结果。本页对比各平台的连接方式：微信通过 ClawBot 扫码连接，钉钉需要创建机器人应用并配置凭证，飞书连接教程正在完善中。可以按团队常用的工具选择连接方式。

通过微信 ClawBot 把科搭 Codar 连接到微信：扫码完成连接后，就能在微信里给 Codar 发送远程任务并接收执行结果，不用一直守在电脑前。本文介绍扫码连接、发送远程任务和解除连接的步骤，以及扫码后无法连接、收不到结果等问题的排查。

手把手把科搭 Codar 接入钉钉：创建钉钉应用，添加并配置机器人，开通机器人权限，获取应用凭证，再在 Codar 中完成连接。连接后可以直接在钉钉里给 Codar 发送任务、接收执行结果。文末附验证失败等常见问题的排查方法。

了解 Codar 的飞书消息平台连接功能。

介绍科搭 Codar 的模型配置：如何启用 SpeedAI 官方模型服务，如何填写 API 类型、API Base 和 API Key 接入第三方模型，如何设置全局默认模型和对话级模型，以及不同任务类型的模型推荐和常用参数调优方法。

了解科搭 Codar 的权限控制和领域选择：不同权限等级允许 Agent 做什么、如何设置、权限边界在哪里；领域选择如何影响 Agent 的专业术语和分析方式，有哪些内置领域，以及权限与领域如何组合使用。

了解科搭 Codar 的点数（Credits）计费方式：不同操作消耗不同点数，可在个人中心选择点数套餐，用微信支付或支付宝在线充值，并随时查看剩余点数。需要报销时，可以通过 SpeedAI 微信客服申请电子发票，本文说明需要提供的订单和开票信息。

Codar 的远程 SSH 连接可以让 Agent 在远程服务器上执行数据分析、环境配置和计算任务，适合需要 GPU、大数据存储或特定运行环境的研究。本文介绍如何在设置中添加 SSH 连接，选择密钥或密码登录，以及编辑、删除和自动重连等连接管理。

四个用科搭 Codar 生信模式完成的真实分析：PBMC 免疫图谱、细胞注释方法对比、IFN-β 响应伪 bulk 差异表达、肺腺癌铜死亡亚型与生存分析。均使用 GEO 等公开数据，附完整步骤、结果图和统计表。

用科搭 Codar 生信模式分析 10x Genomics PBMC 3k 公开数据：质量控制、高变基因、PCA、Leiden 聚类、UMAP、细胞类型注释与 Marker 验证，附完整操作步骤和结果图。

基于 GSE226039 健康人 PBMC 数据，用 CellTypist、SingleR 和经典 Marker 分别完成细胞类型注释，并用一致率、Cohen's κ、ARI 和 NMI 比较三种方法的一致性与分歧。

基于 GSE96583 单细胞数据，按供体配对做伪 bulk 差异表达和 ISG 评分，比较 IFN-β 刺激后 8 类 PBMC 的响应强度、共享差异基因与细胞类型特异性响应。

基于 GSE131907 单细胞数据识别肺腺癌恶性细胞，计算铜死亡基因模块活性并做 NMF 转录分型，结合肿瘤微环境分析，并在 TCGA-LUAD 队列中探索亚型与总生存的关联。